Родился 11 июля в д. Большой Шокшем Сернурского района Марийской АССР. В 1980 году окончил сельскохозяйственный факультет Марийского государственного университета по специальности «Агрономия» с присвоением квалификации «Ученый-агроном». Вел научные исследования, закончил аспирантуру при Казанском сельскохозяйственном институте. В 1988 году защитил кандидатскую диссертацию. Затем учился в докторантуре НИИ сельского хозяйства центральных районов Нечерноземной зоны.

В 1994 году защитил докторскую диссертацию по теме «Теоретические и агротехнические основы повышения урожайности озимой ржи в восточной части Волго-Вятской зоны». В ноябре 1995 году возглавил кафедру растениеводства МарГУ.

В мае 1998 году на конференции трудового коллектива МарГУ был избран ректором. За это время В.И. Макаров показал себя умелым организатором научно-исследовательской деятельности ученых вуза. Он становится руководителем проблемной научной лаборатории «Методы и средства повышения урожайности сельскохозяйствен­ных культур», председателем совета по защите кандидатских диссертаций, а с 2004 года возглавляет докторский совет по трем специальностям: «Общее земледелие», «Растениеводство», «Защита растений».

1 января 2008 года старейший вуз республики МГПИ им. Н.К. Крупской и Марийский государственный университет объединились. 22 апреля 2008 году делегаты структурных подразделений обоих вузов избирали ректором доктора сельскохозяйственных наук, профессора В.И. Макарова. Целеустремленная деятельность В.И. Макарова направлена на налаживание тесного сотрудничества с российскими и зарубежными образовательными научными центрами. Член совета по научно-технической политике при Правительстве Марий Эл, депутат Государственного собрания Республики Марий Эл, лауреат Государственной премии РМЭ в области сельскохозяйственного производства им. В.П. Мосолова.

Признанием заслуг ученого стало присвоение почетных званий «Заслуженный деятель науки Республики Марий Эл», «Заслуженный деятель науки РФ». За выдающиеся профессиональные достижения, вклад в развитие современного общества и национального единства, способствующего процветанию, славе и величию России ректор университета 27 декабря 2009 года награжден орденом «Заслуженный гражданин России».